Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ9

4932414N04Rik, RIKEN cDNA 4932414N04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4932414N04RikQ8CEQ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
4932414N04RikQ8CEQ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4932414N04RikQ8CEQ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
4932414N04RikQ8CEQ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
4932414N04RikQ8CEQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
4932414N04RikQ8CEQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4932414N04RikQ8CEQ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4932414N04RikQ8CEQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4932414N04RikQ8CEQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
4932414N04RikQ8CEQ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms