Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Ccdc178Q8CDV0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc178Q8CDV0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc178Q8CDV0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ccdc178Q8CDV0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Ccdc178Q8CDV0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc178Q8CDV0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc178Q8CDV0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Ccdc178Q8CDV0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc178Q8CDV0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc178Q8CDV0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc178Q8CDV0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc178Q8CDV0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ccdc178Q8CDV0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc178Q8CDV0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms