Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RybpQ8CCI5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RybpQ8CCI5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RybpQ8CCI5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RybpQ8CCI5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RybpQ8CCI5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RybpQ8CCI5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RybpQ8CCI5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RybpQ8CCI5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RybpQ8CCI5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RybpQ8CCI5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RybpQ8CCI5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms