Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB96

Rassf4, Ras association domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf4Q8CB96 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Rassf4Q8CB96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rassf4Q8CB96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rassf4Q8CB96 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rassf4Q8CB96 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rassf4Q8CB96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rassf4Q8CB96 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rassf4Q8CB96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rassf4Q8CB96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rassf4Q8CB96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rassf4Q8CB96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rassf4Q8CB96 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Rassf4Q8CB96 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rassf4Q8CB96 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rassf4Q8CB96 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Rassf4Q8CB96 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rassf4Q8CB96 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rassf4Q8CB96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rassf4Q8CB96 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rassf4Q8CB96 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rassf4Q8CB96 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rassf4Q8CB96 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rassf4Q8CB96 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms