Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CntrobQ8CB62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CntrobQ8CB62 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CntrobQ8CB62 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CntrobQ8CB62 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CntrobQ8CB62 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CntrobQ8CB62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CntrobQ8CB62 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CntrobQ8CB62 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CntrobQ8CB62 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms