Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB59

Fam161b, Protein FAM161B, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam161bQ8CB59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Fam161bQ8CB59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Fam161bQ8CB59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Fam161bQ8CB59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Fam161bQ8CB59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Fam161bQ8CB59 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Fam161bQ8CB59 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Fam161bQ8CB59 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Fam161bQ8CB59 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fam161bQ8CB59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fam161bQ8CB59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms