Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwc2Q8C8N3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Vwc2Q8C8N3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Vwc2Q8C8N3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vwc2Q8C8N3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vwc2Q8C8N3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vwc2Q8C8N3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vwc2Q8C8N3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vwc2Q8C8N3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms