Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dclre1bQ8C7W7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Dclre1bQ8C7W7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Dclre1bQ8C7W7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Dclre1bQ8C7W7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Dclre1bQ8C7W7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dclre1bQ8C7W7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dclre1bQ8C7W7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclre1bQ8C7W7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclre1bQ8C7W7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 773.7 ms