Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U9

Ubqln3, Ubiquilin-3, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln3Q8C5U9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubqln3Q8C5U9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubqln3Q8C5U9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ubqln3Q8C5U9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubqln3Q8C5U9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubqln3Q8C5U9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubqln3Q8C5U9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubqln3Q8C5U9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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