Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rft1Q8C3B8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rft1Q8C3B8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rft1Q8C3B8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rft1Q8C3B8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rft1Q8C3B8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rft1Q8C3B8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rft1Q8C3B8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rft1Q8C3B8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms