Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1R3

Uncharacterized protein C17orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C1R3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Q8C1R3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Q8C1R3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Q8C1R3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Q8C1R3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8C1R3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Q8C1R3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Q8C1R3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8C1R3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Q8C1R3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Q8C1R3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Q8C1R3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8C1R3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q8C1R3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8C1R3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q8C1R3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q8C1R3 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Q8C1R3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8C1R3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Q8C1R3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Q8C1R3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Q8C1R3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms