Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rdh12Q8BYK4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rdh12Q8BYK4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rdh12Q8BYK4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rdh12Q8BYK4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rdh12Q8BYK4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rdh12Q8BYK4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh12Q8BYK4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh12Q8BYK4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rdh12Q8BYK4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh12Q8BYK4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms