Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Usp47Q8BY87 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Usp47Q8BY87 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Usp47Q8BY87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Usp47Q8BY87 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Usp47Q8BY87 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Usp47Q8BY87 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Usp47Q8BY87 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Usp47Q8BY87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Usp47Q8BY87 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Usp47Q8BY87 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Usp47Q8BY87 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Usp47Q8BY87 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Usp47Q8BY87 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
Usp47Q8BY87 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Usp47Q8BY87 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Usp47Q8BY87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Usp47Q8BY87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Usp47Q8BY87 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Usp47Q8BY87 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Usp47Q8BY87 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Usp47Q8BY87 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
Usp47Q8BY87 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Usp47Q8BY87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Usp47Q8BY87 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Usp47Q8BY87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Usp47Q8BY87 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Usp47Q8BY87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms