Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ube3dQ8BX13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ube3dQ8BX13 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3dQ8BX13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3dQ8BX13 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ube3dQ8BX13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube3dQ8BX13 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube3dQ8BX13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ube3dQ8BX13 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ube3dQ8BX13 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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