Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ctdsp2Q8BX07 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ctdsp2Q8BX07 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ctdsp2Q8BX07 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdsp2Q8BX07 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ctdsp2Q8BX07 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ctdsp2Q8BX07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ctdsp2Q8BX07 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctdsp2Q8BX07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctdsp2Q8BX07 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ctdsp2Q8BX07 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctdsp2Q8BX07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms