Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW72

Kdm4a, Lysine-specific demethylase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4aQ8BW72 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm4aQ8BW72 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm4aQ8BW72 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Kdm4aQ8BW72 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kdm4aQ8BW72 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kdm4aQ8BW72 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Kdm4aQ8BW72 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kdm4aQ8BW72 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Kdm4aQ8BW72 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm4aQ8BW72 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm4aQ8BW72 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm4aQ8BW72 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kdm4aQ8BW72 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Kdm4aQ8BW72 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Kdm4aQ8BW72 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Kdm4aQ8BW72 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms