Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSQ9

Pbrm1, Protein polybromo-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbrm1Q8BSQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC42.11■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Pbrm1Q8BSQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
Pbrm1Q8BSQ9 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Pbrm1Q8BSQ9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Pbrm1Q8BSQ9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC42.02■■■■■ 4.32
Pbrm1Q8BSQ9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
Pbrm1Q8BSQ9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.99■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC41.95■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.31
Pbrm1Q8BSQ9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Pbrm1Q8BSQ9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
Pbrm1Q8BSQ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Pbrm1Q8BSQ9 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Pbrm1Q8BSQ9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Pbrm1Q8BSQ9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Pbrm1Q8BSQ9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Pbrm1Q8BSQ9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
Pbrm1Q8BSQ9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Pbrm1Q8BSQ9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Pbrm1Q8BSQ9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Pbrm1Q8BSQ9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Pbrm1Q8BSQ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.73■■■■■ 4.27
Pbrm1Q8BSQ9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
Pbrm1Q8BSQ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Pbrm1Q8BSQ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC41.56■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC41.52■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC41.51■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Pbrm1Q8BSQ9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC41.43■■■■■ 4.22
Pbrm1Q8BSQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
Pbrm1Q8BSQ9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
Pbrm1Q8BSQ9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC41.37■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
Pbrm1Q8BSQ9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC41.31■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
Pbrm1Q8BSQ9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
Pbrm1Q8BSQ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
Pbrm1Q8BSQ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Pbrm1Q8BSQ9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1180 ms