Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tyw3Q8BSA9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tyw3Q8BSA9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tyw3Q8BSA9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tyw3Q8BSA9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tyw3Q8BSA9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tyw3Q8BSA9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tyw3Q8BSA9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tyw3Q8BSA9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tyw3Q8BSA9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tyw3Q8BSA9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms