Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
5730596B20RikQ8BQ08 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
5730596B20RikQ8BQ08 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
5730596B20RikQ8BQ08 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
5730596B20RikQ8BQ08 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
5730596B20RikQ8BQ08 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms