Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMP6

Acbd3, Golgi resident protein GCP60, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acbd3Q8BMP6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Acbd3Q8BMP6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Acbd3Q8BMP6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Acbd3Q8BMP6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Acbd3Q8BMP6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Acbd3Q8BMP6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Acbd3Q8BMP6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Acbd3Q8BMP6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Acbd3Q8BMP6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Acbd3Q8BMP6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Acbd3Q8BMP6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Acbd3Q8BMP6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms