Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHK2

Scn3b, Sodium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3bQ8BHK2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Scn3bQ8BHK2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3bQ8BHK2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Scn3bQ8BHK2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Scn3bQ8BHK2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Scn3bQ8BHK2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scn3bQ8BHK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scn3bQ8BHK2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn3bQ8BHK2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn3bQ8BHK2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn3bQ8BHK2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn3bQ8BHK2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn3bQ8BHK2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms