Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHD4

Frmd3, FERM domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd3Q8BHD4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Frmd3Q8BHD4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Frmd3Q8BHD4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Frmd3Q8BHD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Frmd3Q8BHD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Frmd3Q8BHD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Frmd3Q8BHD4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Frmd3Q8BHD4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Frmd3Q8BHD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Frmd3Q8BHD4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Frmd3Q8BHD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms