Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tor4aQ8BH02 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Tor4aQ8BH02 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tor4aQ8BH02 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tor4aQ8BH02 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tor4aQ8BH02 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Tor4aQ8BH02 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Tor4aQ8BH02 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tor4aQ8BH02 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tor4aQ8BH02 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tor4aQ8BH02 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tor4aQ8BH02 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Tor4aQ8BH02 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tor4aQ8BH02 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Tor4aQ8BH02 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tor4aQ8BH02 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tor4aQ8BH02 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tor4aQ8BH02 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tor4aQ8BH02 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Tor4aQ8BH02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tor4aQ8BH02 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms