Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smndc1Q8BGT7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smndc1Q8BGT7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smndc1Q8BGT7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smndc1Q8BGT7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smndc1Q8BGT7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smndc1Q8BGT7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smndc1Q8BGT7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smndc1Q8BGT7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smndc1Q8BGT7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Smndc1Q8BGT7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Smndc1Q8BGT7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms