Protein–RNA interactions for Protein: Q811Q9

Pcyt1b, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcyt1bQ811Q9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcyt1bQ811Q9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcyt1bQ811Q9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcyt1bQ811Q9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcyt1bQ811Q9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcyt1bQ811Q9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcyt1bQ811Q9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcyt1bQ811Q9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcyt1bQ811Q9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcyt1bQ811Q9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcyt1bQ811Q9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcyt1bQ811Q9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms