Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

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Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pkhd1l1Q80ZA4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkhd1l1Q80ZA4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkhd1l1Q80ZA4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkhd1l1Q80ZA4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pkhd1l1Q80ZA4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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