Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NanogQ80Z64 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NanogQ80Z64 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NanogQ80Z64 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NanogQ80Z64 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NanogQ80Z64 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NanogQ80Z64 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NanogQ80Z64 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NanogQ80Z64 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NanogQ80Z64 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms