Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc1Q80VQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc1Q80VQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc1Q80VQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lrrc1Q80VQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Lrrc1Q80VQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Lrrc1Q80VQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lrrc1Q80VQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lrrc1Q80VQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lrrc1Q80VQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lrrc1Q80VQ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms