Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifna12Q80SS5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ifna12Q80SS5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ifna12Q80SS5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifna12Q80SS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ifna12Q80SS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Ifna12Q80SS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ifna12Q80SS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifna12Q80SS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifna12Q80SS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ifna12Q80SS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms