Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rps6ka6Q7TPS0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rps6ka6Q7TPS0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rps6ka6Q7TPS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rps6ka6Q7TPS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Rps6ka6Q7TPS0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rps6ka6Q7TPS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rps6ka6Q7TPS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rps6ka6Q7TPS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms