Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Letm2Q7TNU7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Letm2Q7TNU7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Letm2Q7TNU7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Letm2Q7TNU7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Letm2Q7TNU7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Letm2Q7TNU7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Letm2Q7TNU7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Letm2Q7TNU7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.9 ms