Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Rtl1Q7M732 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC46.55■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.53■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.52■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
Rtl1Q7M732 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
Rtl1Q7M732 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rtl1Q7M732 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
Rtl1Q7M732 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
Rtl1Q7M732 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Rtl1Q7M732 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC46.42■■■■■ 5.02
Rtl1Q7M732 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
Rtl1Q7M732 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC46.36■■■■■ 5.01
Rtl1Q7M732 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
Rtl1Q7M732 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Rtl1Q7M732 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.31■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC46.27■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
Rtl1Q7M732 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC46.21■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC46.2■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC46.19■■■■■ 4.99
Rtl1Q7M732 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC46.14■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Rtl1Q7M732 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.1■■■■■ 4.97
Rtl1Q7M732 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
Rtl1Q7M732 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
Rtl1Q7M732 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Rtl1Q7M732 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Rtl1Q7M732 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
Rtl1Q7M732 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
Rtl1Q7M732 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Rtl1Q7M732 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
Rtl1Q7M732 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Rtl1Q7M732 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Rtl1Q7M732 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.91■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Rtl1Q7M732 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC45.87■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC45.84■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.83■■■■■ 4.93
Rtl1Q7M732 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.8■■■■■ 4.92
Rtl1Q7M732 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
Rtl1Q7M732 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Rtl1Q7M732 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.74■■■■■ 4.91
Rtl1Q7M732 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Rtl1Q7M732 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
Rtl1Q7M732 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Rtl1Q7M732 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC45.69■■■■■ 4.9
Rtl1Q7M732 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Rtl1Q7M732 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
Rtl1Q7M732 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Rtl1Q7M732 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Rtl1Q7M732 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms