Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPK0

Phf21a, PHD finger protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf21aQ6ZPK0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Phf21aQ6ZPK0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Phf21aQ6ZPK0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Phf21aQ6ZPK0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Phf21aQ6ZPK0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Phf21aQ6ZPK0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Phf21aQ6ZPK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Phf21aQ6ZPK0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Phf21aQ6ZPK0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Phf21aQ6ZPK0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms