Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3F0

P4ha3, Prolyl 4-hydroxylase subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P4ha3Q6W3F0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
P4ha3Q6W3F0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
P4ha3Q6W3F0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
P4ha3Q6W3F0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
P4ha3Q6W3F0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
P4ha3Q6W3F0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P4ha3Q6W3F0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P4ha3Q6W3F0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P4ha3Q6W3F0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms