Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc88cQ6VGS5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc88cQ6VGS5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccdc88cQ6VGS5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc88cQ6VGS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc88cQ6VGS5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc88cQ6VGS5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc88cQ6VGS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc88cQ6VGS5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms