Protein–RNA interactions for Protein: Q6RKD8

Flrt1, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flrt1Q6RKD8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Flrt1Q6RKD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Flrt1Q6RKD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Flrt1Q6RKD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Flrt1Q6RKD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Flrt1Q6RKD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Flrt1Q6RKD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Flrt1Q6RKD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Flrt1Q6RKD8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms