Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx13Q6PHS6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx13Q6PHS6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Snx13Q6PHS6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Snx13Q6PHS6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Snx13Q6PHS6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Snx13Q6PHS6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Snx13Q6PHS6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Snx13Q6PHS6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
Snx13Q6PHS6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Snx13Q6PHS6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Snx13Q6PHS6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Snx13Q6PHS6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms