Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHQ9

Pabpc4, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4Q6PHQ9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pabpc4Q6PHQ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pabpc4Q6PHQ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Pabpc4Q6PHQ9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Pabpc4Q6PHQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Pabpc4Q6PHQ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pabpc4Q6PHQ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pabpc4Q6PHQ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pabpc4Q6PHQ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pabpc4Q6PHQ9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pabpc4Q6PHQ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pabpc4Q6PHQ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms