Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGG2

Gmip, GEM-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GmipQ6PGG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GmipQ6PGG2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GmipQ6PGG2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
GmipQ6PGG2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GmipQ6PGG2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GmipQ6PGG2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GmipQ6PGG2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GmipQ6PGG2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GmipQ6PGG2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GmipQ6PGG2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GmipQ6PGG2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GmipQ6PGG2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GmipQ6PGG2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GmipQ6PGG2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GmipQ6PGG2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GmipQ6PGG2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms