Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim45Q6PFY8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim45Q6PFY8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim45Q6PFY8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trim45Q6PFY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim45Q6PFY8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Trim45Q6PFY8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trim45Q6PFY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms