Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Zbtb39Q6PDK0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Zbtb39Q6PDK0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zbtb39Q6PDK0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Zbtb39Q6PDK0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbtb39Q6PDK0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbtb39Q6PDK0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zbtb39Q6PDK0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Zbtb39Q6PDK0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Zbtb39Q6PDK0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zbtb39Q6PDK0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbtb39Q6PDK0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbtb39Q6PDK0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbtb39Q6PDK0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zbtb39Q6PDK0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbtb39Q6PDK0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbtb39Q6PDK0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbtb39Q6PDK0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbtb39Q6PDK0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Zbtb39Q6PDK0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbtb39Q6PDK0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Zbtb39Q6PDK0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zbtb39Q6PDK0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zbtb39Q6PDK0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Zbtb39Q6PDK0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms