Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atl2Q6PA06 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atl2Q6PA06 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atl2Q6PA06 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atl2Q6PA06 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atl2Q6PA06 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atl2Q6PA06 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atl2Q6PA06 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atl2Q6PA06 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Atl2Q6PA06 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atl2Q6PA06 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atl2Q6PA06 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atl2Q6PA06 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atl2Q6PA06 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms