Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Dnajc8Q6NZB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Dnajc8Q6NZB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnajc8Q6NZB0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnajc8Q6NZB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnajc8Q6NZB0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dnajc8Q6NZB0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnajc8Q6NZB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dnajc8Q6NZB0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dnajc8Q6NZB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms