Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXY9

Polr3g, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC7, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3gQ6NXY9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Polr3gQ6NXY9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Polr3gQ6NXY9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Polr3gQ6NXY9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Polr3gQ6NXY9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Polr3gQ6NXY9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Polr3gQ6NXY9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Polr3gQ6NXY9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Polr3gQ6NXY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Polr3gQ6NXY9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms