Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Capn11Q6J756 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Capn11Q6J756 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Capn11Q6J756 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn11Q6J756 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Capn11Q6J756 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn11Q6J756 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Capn11Q6J756 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Capn11Q6J756 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Capn11Q6J756 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Capn11Q6J756 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Capn11Q6J756 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Capn11Q6J756 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Capn11Q6J756 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Capn11Q6J756 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms