Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arhgap20Q6IFT4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arhgap20Q6IFT4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arhgap20Q6IFT4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap20Q6IFT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Arhgap20Q6IFT4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap20Q6IFT4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arhgap20Q6IFT4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arhgap20Q6IFT4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Arhgap20Q6IFT4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Arhgap20Q6IFT4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arhgap20Q6IFT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Arhgap20Q6IFT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Arhgap20Q6IFT4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Arhgap20Q6IFT4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms