Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
N4bp1Q6A037 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
N4bp1Q6A037 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
N4bp1Q6A037 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
N4bp1Q6A037 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
N4bp1Q6A037 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
N4bp1Q6A037 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
N4bp1Q6A037 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
N4bp1Q6A037 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4bp1Q6A037 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
N4bp1Q6A037 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
N4bp1Q6A037 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
N4bp1Q6A037 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
N4bp1Q6A037 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
N4bp1Q6A037 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
N4bp1Q6A037 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
N4bp1Q6A037 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
N4bp1Q6A037 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms