Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmcc1Q69ZZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmcc1Q69ZZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmcc1Q69ZZ6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmcc1Q69ZZ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmcc1Q69ZZ6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tmcc1Q69ZZ6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tmcc1Q69ZZ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.8 ms