Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sh3rf1Q69ZI1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sh3rf1Q69ZI1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sh3rf1Q69ZI1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sh3rf1Q69ZI1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sh3rf1Q69ZI1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sh3rf1Q69ZI1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Sh3rf1Q69ZI1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
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