Protein–RNA interactions for Protein: Q66X19

Nlrp4e, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4E, mousemouse

Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4eQ66X19 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrp4eQ66X19 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrp4eQ66X19 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrp4eQ66X19 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrp4eQ66X19 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrp4eQ66X19 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrp4eQ66X19 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Nlrp4eQ66X19 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nlrp4eQ66X19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Nlrp4eQ66X19 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nlrp4eQ66X19 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nlrp4eQ66X19 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Nlrp4eQ66X19 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4eQ66X19 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp4eQ66X19 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms